Klinisk akademiker til bioinformatisk analyse af NGS data fra prostatacancer / Clinical academic for bioinformatic analysis of NGS data from prostate cancer, MOMA, AUH

Klinisk akademiker til bioinformatisk analyse af NGS data fra prostatacancer

Prostata cancer (PC) forskningsgruppen ved Molekylær Medicinsk Afdeling (MOMA), Aarhus Universitetshospital arbejder med udvikling af nye molekylær diagnostiske værktøjer til patienter med PC. Gruppen ledes af professor Karina Dalsgaard Sørensen.

Dette opslag omhandler bioinformatiske analyser af epigenom (cfMeDIP-seq), genom (low-pass whole genome sequencing) og transskriptom (RNA-seq) data for PC vævsprøver og flydende biopsies mhp at kortlægge de molekylære mekanismer som ligger til grund for at nogle tumorer udvikler sig aggressivt, mens andre forbliver fredelige. 

Til analyse af sådanne NGS data, søger afdelingen nu en molekylær biolog eller lignende med stor bioinformatisk erfaring. Der er tale om en fuldtidsstilling på 37 timer/uge. 

Stillingen er ledig til besættelse pr. 15. august 2024 og er tidsbegrænset til 14. august 2026. 

De opgaver der ønskes varetaget i stillingen er

• Bioinformatisk og statistisk analyse af PC epigenom og genom data (cfMeDIPseq og lpWGS data)
• Bioinformatisk og statistisk analyse af RNAseq data for PC (short-read og long-read)
• Bidrage til at skrive og publicere resultater fra forskningsprojektet.

Forventede kvalifikationer

• Ph.d.-grad indenfor molekylær biologi/genetik eller lignende
• Erfaring med bioinformatisk håndtering af NGS datasæt, herunder data visualisering og statistisk analyse
• Praktisk erfaring med NGS data analyse i R
• Kendskab til cancer/evolutions biologi
• Selvstændig, handlingsorienteret og målrettet
• Gode kommunikations- og samarbejdsevner.

Løn- og ansættelsesvilkår i henhold til gældende overenskomst. Ansættelsen er betinget af en tilfredsstillende børneattest.  

Yderligere informationer om stillingen kan fås ved henvendelse til Professor Karina Dalsgaard Sørensen på 7845 5316.

Kontaktperson: Karina Dalsgaard Sørensen, tlf.: 7845 5316 eller Mie Gade Farsinsen, tlf.: 7845 5310

Clinical academic for bioinformatic analysis of NGS data from prostate cancer

The Prostate Cancer (PC) research group at the Molecular Medicine Department (MOMA), Aarhus University Hospital, is working on developing new molecular diagnostic tools for patients with PC. The group is led by Professor Karina Dalsgaard Sørensen.

This posting concerns bioinformatic analyses of epigenome (cfMeDIP-seq), genome (low-pass whole genome sequencing), and transcriptome (RNA-seq) data for PC tissue samples and liquid biopsies aimed at mapping the molecular mechanisms underlying why some tumors develop aggressively while others remain benign.

For the analysis of such NGS data, the department is now seeking a molecular biologist or similar with extensive bioinformatic experience. The position is full-time, 37 hours/week. The position is available for filling from August 15, 2024, and is limited until August 14, 2026.

The tasks to be performed in the position include

• Bioinformatic and statistical analysis of PC epigenome and genome data (cfMeDIPseq and lpWGS data)
• Bioinformatic and statistical analysis of RNAseq data for PC (short-read and long-read)
• Contribution to writing and publishing results from the research project.

Expected qualifications

• PhD degree in molecular biology/genetics or similar
• Experience with bioinformatic handling of NGS datasets, including data visualization and statistical analysis
• Practical experience with NGS data analysis in R
• Knowledge of cancer/evolutionary biology
• Independent, proactive, and goal-oriented
• Good communication and collaboration skills.

Salary and employment conditions in accordance with applicable collective agreement. Employment is conditional on a satisfactory child report (or criminal record if a child report cannot be obtained).

Further information about the position can be obtained by contacting Professor Karina Dalsgaard Sørensen at 7845 5316.

Contact person: Karina Dalsgaard Sørensen, phone: 7845 5316 or Mie Gade Farsinsen, phone: 7845 5310.

Stillingen er som udgangspunkt en fuldtidsstilling.

Da Region Midtjylland løbende gennemfører besparelser og omorganiseringer, vil medarbejdere i omplacering, der søger stillingen, have fortrinsret.