PH.D. PROJEKT – MIKROBIOMETS BETYDNING HOS BØRN BEHANDLET MED STAMCELLETRANSPLANTATION

Juliane Marie Centret

Vi, på børneonkologisk laboratorium (Bonkolab), søger en læge til et ph.d.-projekt inden for områderne hæmatologi og immunologi hos børn.

Baggrund
Hæmatopoietisk stamcelletransplantation (HSCT) kan være en nødvendig og livsreddende behandling af børn med højrisiko leukæmi, men ledsages af alvorlige bivirkninger i form af immundefekt og organskader, der kan være livstruende. Vi ved i dag at de naturlige tarmbakterier (tarmmikrobiomet) har en central betydning for mange biologiske funktioner og udvikling af sygdom, og det er blevet klart at mikrobiomet desværre lider betydelig skade under kræftbehandling. I vores tidligere studier har vi fundet et tab af de naturlige gavnlige bakterier og overvækst med skadelige bakterier, der medfører inflammation og skader på tarmslimhinden, som bliver indgangsport for svære infektioner. Men for at kunne forebygge disse skader skal vi vide mere om, hvordan mikrobiomet ændres samt hvordan dette påvirker immunsystemet.
I det aktuelle ph.d.-projekt undersøges, hvilken rolle ændringer i tarmens naturlige og gavnlige bakterier spiller for udviklingen af bivirkninger og tab af immunfunktioner efter stamcelletransplantation. Dette vil kunne bane vejen for forebyggende behandling via stabilisering af de naturlige og gavnlige bakteriefunktioner.

Forskning i et veletableret forskningsmiljø
Ph.d.-studiet skal karakterisere mikrobiomet hos 125 børn behandlet med HSCT på Rigshospitalet. Projektet drager nytte af allerede indsamlet materiale fra perioden 2015-2023, som har resulteret i en internationalt unik biobank med tilhørende database over de kliniske informationer. Dette vil kunne give os helt ny viden, der tidligere ikke har været tilgængelig via eksisterende kohorter internationalt.
Din hverdag vil foregå på Bonkolab, som er Nordens største enhed for børnekræftforskning med mere end 130 ansatte. Du vil indgå i et fællesskab med en større gruppe ph.d.-studerende og post.docs., som alle forsker i kræft hos børn og unge, og du vil ligeledes blive tilknyttet en forskningsgruppe med stor erfaring inden for mikrobiom-forskning bestående af bl.a. bioinformatikere og kliniske forskere (COPSAC).

Din forskning vil primært omhandle:

• Koordinering af mikrobiom-sekventering og databasehåndtering
• Uddannelse i bioinformatiske analyser
• Håndtering og klinisk fortolkning af mikrobiom- og immunologisk data
• Videnskabelig formidling, især via publikationer både nationalt og internationalt
• Indgå i et team, der styrer den prospektive patientinklusion og indsamling af kliniske prøver
• Du vil få støtte af et team af statistikere, bioinformatikere og erfarne forskerne inden for mikrobiom-området

Kvalifikationer:

• Uddannet læge
• Ser analyse af komplekse data som en spændende udfordring mhp. at forstå sygdomsprocesser
• Programmering i R eller lignende er en fordel men ikke et krav
• Du er stærk skriftligt og mundtligt niveau på engelsk
• Du er glad for at indgå i et tværfagligt samarbejde

Ansættelsesvilkår
Løn og ansættelsesvilkår følger overenskomst og aftaler for Region H.

Stillinger i Juliane Marie Centeret er omfattet af bekendtgørelse om indhentelse af børneattest. Det er derfor en forudsætning for ansættelse, at du har en blank børneattest. Centret indhenter attesten hos Rigspolitiet efter samtykke hos ansøger.

Rigshospitalet er en røgfri arbejdsplads.

Rigshospitalet er en del af Region Hovedstaden.

Ansøgningsprocedure
Skriftlig ansøgning med CV og karakterblad modtages via linket senest 1/4-2024. Ansættelsessamtaler påtænkes afsluttet senest 14/4-2024.

Ved behov for yderligere information rettes henvendelse til post.doc Maria Ebbesen Sørum på 40638545 eller [email protected] eller professor Klaus Müller, [email protected]